Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GINS2Q9Y248 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GINS2Q9Y248 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GINS2Q9Y248 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms