Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN8AQ9UQD0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN8AQ9UQD0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms