Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNND2Q9UQB3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTNND2Q9UQB3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTNND2Q9UQB3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms