Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNRC6BQ9UPQ9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms