Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGAP1Q9UPQ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGAP1Q9UPQ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP1Q9UPQ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms