Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PHF8Q9UPP1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PHF8Q9UPP1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PHF8Q9UPP1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms