Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCG2Q9UNQ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCG2Q9UNQ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms