Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX6Q9UNH7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms