Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX7Q9UNH6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX7Q9UNH6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX7Q9UNH6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX7Q9UNH6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms