Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SYNPO2Q9UMS6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNPO2Q9UMS6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms