Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ZNF608Q9ULD9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ZNF608Q9ULD9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ZNF608Q9ULD9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms