Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGA11Q9UKX5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGA11Q9UKX5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms