Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMFRQ9UKV5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMFRQ9UKV5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms