Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC42EP3Q9UKI2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms