Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHORDC1Q9UHD1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHORDC1Q9UHD1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHORDC1Q9UHD1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms