Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EBF1Q9UH73 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms