Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT8Q9UFF9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNOT8Q9UFF9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNOT8Q9UFF9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms