Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PEF1Q9UBV8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PEF1Q9UBV8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 361.1 ms