Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DBF4Q9UBU7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DBF4Q9UBU7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms