Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC6Q9UBN7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC6Q9UBN7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms