Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GALPQ9UBC7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GALPQ9UBC7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GALPQ9UBC7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GALPQ9UBC7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GALPQ9UBC7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALPQ9UBC7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALPQ9UBC7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALPQ9UBC7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALPQ9UBC7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GALPQ9UBC7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms