Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TFIP11Q9UBB9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TFIP11Q9UBB9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TFIP11Q9UBB9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms