Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CC2D2AQ9P2K1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
CC2D2AQ9P2K1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CC2D2AQ9P2K1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CC2D2AQ9P2K1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms