Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTGFRNQ9P2B2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms