Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCNT4Q9P109 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT4Q9P109 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT4Q9P109 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms