Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXXC1Q9P0U4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXXC1Q9P0U4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXXC1Q9P0U4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms