Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKIPSDQ9NZQ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms