Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARHGEF12Q9NZN5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARHGEF12Q9NZN5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARHGEF12Q9NZN5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms