Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BARHL2Q9NY43 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BARHL2Q9NY43 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms