Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY12

GAR1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAR1Q9NY12 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAR1Q9NY12 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GAR1Q9NY12 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms