Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALKBH4Q9NXW9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ALKBH4Q9NXW9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ALKBH4Q9NXW9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms