Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAJC28Q9NX36 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNAJC28Q9NX36 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms