Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARVAQ9NVD7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PARVAQ9NVD7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PARVAQ9NVD7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms