Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTG1Q9NSN8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNTG1Q9NSN8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms