Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HOMER2Q9NSB8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOMER2Q9NSB8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOMER2Q9NSB8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms