Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms