Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPANXA1Q9NS26 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms