Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HELLSQ9NRZ9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HELLSQ9NRZ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HELLSQ9NRZ9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms