Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAPOLBQ9NRJ5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAPOLBQ9NRJ5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms