Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRAC1Q9NRG0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRAC1Q9NRG0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRAC1Q9NRG0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRAC1Q9NRG0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRAC1Q9NRG0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRAC1Q9NRG0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRAC1Q9NRG0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRAC1Q9NRG0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRAC1Q9NRG0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms