Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHST12Q9NRB3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHST12Q9NRB3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms