Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRDM8Q9NQV8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRDM8Q9NQV8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms