Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INCENPQ9NQS7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
INCENPQ9NQS7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INCENPQ9NQS7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms