Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYLDQ9NQC7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYLDQ9NQC7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
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