Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RTN4Q9NQC3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RTN4Q9NQC3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RTN4Q9NQC3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms