Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD3Q9NPG1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FZD3Q9NPG1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms