Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NGRNQ9NPE2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NGRNQ9NPE2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms