Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNB1IP1Q9NPC3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNB1IP1Q9NPC3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms