Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPHS2Q9NP85 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHS2Q9NP85 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms