Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C6orf50Q9HD87 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C6orf50Q9HD87 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms